蛋白功能肽及衍生配料研究與應用
功能肽產業化研發部是我國最早從事蛋白資源利用與功能肽研發、成果轉化、產品應用開發的專業團隊，立足于高質量的成果轉化服務和產品應用研究工作，下設生產制造中心、基礎研究中心和營養支持與評價中心，從基礎研究、工藝與工程化研究、產品研發、功能性研究、功能性成分分離鑒定和營養支持與評價等方面全方位為客戶提供系統化服務。部門自主設計并產業化的工程包括年產2500噸大豆肽，年產1500噸海洋肽和玉米肽，年產1200噸小麥肽，以及年產1500噸天然果蔬酵素工程等。自“九五”以來，團隊攻克了多項行業重大關鍵、共性技術難關，在國內第一個實現酶解制備食源性功能肽的工業化生產，在國際上第一個制定出食源性功能肽國家及行業標準；研制生產出系列功能肽配料產品，生產技術和產品質量達到國際領先水平，填補了我國肽類功能配料的空白，攜手國內外頂尖功能保健企業開發肽類營養食品、特殊膳食用食品、保健食品等，形成數十億的肽類終端產品的新興市場和產業，已成為我國功能食品行業中新的經濟增長點。
領域1：天然蛋白功能肽開發及產業化
本部門以天然農林、藥食兩用蛋白資源如小麥、玉米、大豆、魚皮、豌豆、牡蠣、大米、烏雞、驢皮等為原料，采用酶膜耦合、定向酶切等現代生物技術，研制能提升營養保健價值并且易消化吸收的新型天然蛋白功能肽并實現工業化轉化，以天然蛋白功能肽為主要功能配料，開發新型蛋白類營養滋補品及保健食品，實現低值農林資源的高值化利用，促進我國傳統營養保健食品的升級換代。
領域2：肽基發酵果蔬酵素開發及產業化
本部門以水果、蔬菜為主要原料，添加天然蛋白功能肽作為發酵促進劑及功能因子，經復合菌種發酵及調配后，形成富含多種天然植物功能因子、維生素和鈣、磷、鉀等礦物質元素，具有調理胃腸道、提高免疫力、降低膽固醇等食療作用的新一代營養功能飲品。目前，本部門所主持完成的產業化項目擁有5項，研究內容涵蓋工藝研發、菌種選育、功能性成分分離鑒定、產業化設計、質量標準制定等，研制生產出多種功能營養發酵果蔬汁。
領域3：功能肽礦物元素螯合物開發及產業化
本部門以天然蛋白功能肽為載體，制備海洋膠原肽螯合鈣、烏雞肽螯合鐵、牡蠣肽螯合鋅、豌豆肽螯合硒、玉米肽螯合硒等礦物元素螯合物，鑒定其特征性肽螯合物的結構，研究其跨膜轉運機制和吸收影響因素，探索其生理作用發揮機制，從而為天然蛋白功能肽螯合礦物元素的應用奠定基礎。研究表明，功能肽礦物元素螯合物可以直接被腸黏膜細胞吸收，無毒副作用，生物利用率高，是極為理想的新型礦物元素補充劑。基于我國鈣、鐵、鋅、硒等元素缺乏人群的基數，產業化前景廣闊。
領域4：功能肽產品開發及功能肽段精準分析與數據庫技術研究
本部門利用生物發酵與定向酶解的復合手段，綜合提升現有肽產品的原料利用率，功能肽段精準分析評價技術，初步構建基于二肽的鑒定數據庫和生物活性肽數據庫。定向酶解制備特征性功能肽段，開發具有明確功能、有特征肽段、與市場普通肽類產品有區分度的尖端肽產品；完善功能肽數據庫的數據分類信息。
科研骨干
谷瑞增，教授級高級工程師，現任研究院副總經理、黨委委員，功能肽產業化研究發展部主任、北京市蛋白功能肽工程技術研究中心常務副主任。多年來致力于天然農林及藥食兩用資源的綜合利用，促進營養保健產品的升級換代，帶領團隊攻克蛋白質提取、酶膜耦合降解、復合菌種發酵、微生物代謝控制等多項重大技術難關，開發出食源性肽類及天然果蔬酵素產品工業化生產技術，大幅提升了蛋白質資源及果蔬資源的利用價值，延長了資源加工利用產業鏈。
潘興昌，教授級高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部副主任，主要從事食源肽的營養功能評價與應用研究。針對多種食物來源的蛋白肽如海洋魚皮膠原肽、玉米肽、小麥肽等的營養價值與功能效果進行了系統研究，取得了一系列的成果，為食源肽的市場應用提供了有效技術支撐。
陳亮，高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部副主任，長期從事于食源性低聚肽的產品開發、產業化轉化等產品制造工程技術研究以及低聚肽的結構鑒定、作用機制分析等基礎研究工作。
任瑋，高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部副主任，主要從事食源性低聚肽技術成果產業化及市場應用、推廣、渠道建設等工作。
董哲，教授級高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部主任助理，主要從事食源性低聚肽、礦物元素螯合物、果蔬發酵制品等功能保健食品生產線建設及生產基地籌建等工作。
劉文穎，高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部主任助理、基礎研究中心主任，主要負責食源肽和發酵代謝產物基礎研究平臺建設，以及功能肽的結構鑒定、構效關系與分子機制研究等工作。
陸路，高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部生產制造中心主任，主要從事食源性低聚肽及果蔬發酵產品制造技術研發及產業化轉化。
李國明，教授級高級工程師，現任功能肽產業化研究發展部基礎研究中心副主任，長期從事蛋白質和多肽結構、功能及致敏性的基礎研究、成果轉化等工作。
馬永慶，高級工程師，現任中國食品發酵工業研究院有限公司中試車間主任，主要從事食源性低聚肽原料及終端營養保健食品質量標準研究與制定。